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en: The <application>AMIDE</application> User's Manual V0.3
es: Manual de Usuario de <application>AMIDE</application> V0.3

en: AMIDE stands for Amide's a Medical Image Data Examiner. This program is a tool for viewing and analyzing volumetric medical imaging data sets, and has been designed from the ground up with support for multi-modality imaging.
es: AMIDE (Amide's a Medical Image Data Examiner). Este programa es una herramienta para ver y analizar datos multidimensionales médicos , y ha sido diseñado en el terreno de la imagen multimodalidad.

en: This is release 0.3 of the AMIDE User's Manual.
es: Revisión número 0.3 del Manual de AMIDE.

en: Introduction
es: Introducción

en: AMIDE is released under the terms of the <ulink type="http" url="http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html">GNU General Public Library (GPL).</ulink>
es: AMIDE se ha liberado bajo los términos de <ulink type="http" url="http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html">GNU General Public Library (GPL).</ulink>

en: The text of the license is fairly verbose. A quick summary follows:
es: El texto de la licencia es el siguiente:

en: You are free to run the program, for any purpose. Please note that, although the GPL makes no restrictions on use of the program, your government probably does. For instance, in the United States, AMIDE is not FDA approved and cannot be used clinically.
es: Usted es libre de usar este programa para cualquier propósito. Por favor note que, aunque la GPL no hace restricciónes sobre el uso del programa, su gobierno probablablemte sí. Por ejemplo, en Estados Unidos, AMIDE no está aprovado por la FDA y no puede darse uso clínico allí .

en: You are free to study the source code of the program, and adapt it to your needs.
es: Usted es libre de estudiar el código fuente y adaptarlo a sus necesidades.

en: You are free to redistribute the program.
es: Usted es libre de redistribuir el programa.

en: You are free to release modified versions of the program, as long as you also redistribute the source code to the modified program, and you label your modified version of the program appropriately.
es: Usted es libre de sacar versiones modificadas del programa, siempre que también redistribuya el código fuente del programa modificado, y etiquete apropiadamente la versión como modificada.

en: Availability of Source Code
es: Disponibilidad del Código Fuente

en: The source code for AMIDE is readily available from the <ulink type="http" url="http://amide.sourceforge.net">AMIDE web site</ulink>.
es: El Código Fuente de AMIDE está disponble en <ulink type="http" url="http://amide.sourceforge.net">el sitio web de AMIDE</ulink>.

en: Supported Platforms
es: Platformas soportadas

en: In addition to source code, binary versions of AMIDE along with installation instructions can be found for several systems on the <ulink type="http" url="http://amide.sourceforge.net">AMIDE web site</ulink>. The currently supported systems are Linux/i386, Microsoft Windows, and Macintosh OS X (achieved through the use of the <ulink type="http" url="http://fink.sourceforge.net">fink</ulink> add-on packages).
es: Además del Código Fuente, las versiones binarias de AMIDE junto con instruciones de instalacion se pueden encontar <ulink type="http" url="http://amide.sourceforge.net">en el sitio web de AMIDE web</ulink>. Los sistemas soportados actualmente son Linux/i386, Microsoft Windows, y Macintosh OS X (logrado mediante el uso del paquete complementario <ulink type="http" url="http://fink.sourceforge.net">fink</ulink>).

en: Contact Information
es: Información de Contacto

en: Questions and bug reports can be addressed to the AMIDE users list <email> amide-users@lists.sourceforge.net</email>. Information on joining the list and/or viewing archived messages can be found <ulink type="http" url="http://sourceforge.net/mail/?group_id=9464">here</ulink>.
es: Pueden dirigir sus preguntas a lista de usuarios AMIDE <email> amide-users@lists.sourceforge.net </email>. La informacion para unirse a la lista y/o ver mensajes archivados se puede encontrar <ulink type="http" url="http://sourceforge.net/mail/?group_id=9464">aquí</ulink>.

en: AMIDE Basics
es: Fundamentos del Amide

en: As the use of AMIDE is bound to be completely intuitive only to the one who wrote the program (i.e. me), this section provides a brief overview of operating within the program. It assumes you already have a data set loaded in. For instructions on getting a data set into AMIDE, see <xref linkend="importing_data_sets"/>
es: Com el uso de AMIDE es completamente intuitivo sólo para el escribió el programa (es decir yo), este sección proporcióna una breve panorámica de del uso del programa. se asume que tiene estudios cargados. Para ver lasinstruciones para cargar estudios en el AMIDE referirse a <xref linkend="importing_data_sets"/>.

en: A Quick Theory of Operations
es: Teoría Rápida de Operaciones

en: AMIDE Objects
es: Objetos AMIDE

en: Data Set
es: Volumen de Datos

en: A data set object contains the raw information from a medical imaging study, along with the corresponding parameters needed for interpreting that information (thresholds, colormaps, etc.).
es: Un volumen de datos contiene la información cruda de un estudio de imagen médica, junto con los parámetros necesarios para su correcta interpretación con esa información (umbrales, mapas de color, etc.).

en: A region of interest object defines a volume of space over which statistics can be calculated. All ROI's in AMIDE are volumetric. Currently, AMIDE implements ellipsoid, cylinderical, rectangular, and isocontour based ROI geometries.
es: Región de Interés(Region Of Interest,ROI), este objeto define un subvolumen del volumen de datos sobre el cual pueden calcularse estadísticas. Todos los ROI's en AMIDE son volumétricos. Actualmente, AMIDE implementa las siguieintes geometrías en los ROI: elipsoide, cilídrico, rectangular, and isocontornos.

en: Fiducial Mark
es: Marcador Fiducial

en: A very simple object, fiducial marks encode only the location of a reference point in space, and are used for rigid body alignment.
es: Es un objeto muy simple , los Marcadores Fiduciales sólo tiene la información sobre la referencia a un punto del espacio, y son usadas para el alíneamiento de cuerpos rigidos.

en: Study
es: Estudio

en: Each AMIDE session has a single study object, which is used for grouping together a number of related data sets, ROI's, and fiducial marks.
es: Cada sesión de AMIDE tiene un simple objeto de estudio, que se usa para agrupar un número de volúmenes de datos, ROI's, y marcas fiduciales.

en: AMIDE can work with and display a large number of objects simultaneous (limited only be available memory). The object types current implemented in AMIDE are as follows: <placeholder-1/>
es: AMIDE pude trabajar y visualizar multiplicidad de objetos simultáneamente (limitado sólo por la RAM disponible). Los tipos de objetos actualmente implementados en AMIDE son los siguientes: <placeholder-1/>

en: Object Tree
es: Objeto Arbol

en: Study Tree
es: Arbol de Estudio

en: An example of a study's tree structure within AMIDE. The two data sets (FDG PET and microCT) and 1 ROI (bladder) are children of the study object (m2862). The remaining ROI's are children of the data sets.
es: Un ejemplo de árbol de estudio en AMIDE. Los dos volúmenes de datos (FDG PET y microCT) y 1 ROI (vegiga) son hijos del objeto estudio (m2862). Los ROI's restantes son hijos del volumen de datos.

en: In order to facilitate working with a large number of objects simultaneously, AMIDE conceptually groups all objects into a tree hierarchy, with the study object as the root of the tree (see <xref linkend="studytree-fig"/>). Data set objects will generally be primary branches off of the study object, while ROI's can be branches off of the study object or off of individual data sets. Why is this important? Because the structure of the tree determines how movements are mapped within the program. If a data set is moved relative to the rest of the study, the ROI's that are branches from that data set object will be correspondingly moved, so that they will maintain the correct orientation and position with respect to the data set that is their parent.
es: Para facilitar el trabajo con un gran número de objetos simultáneamente, AMIDE conceptualmente agrupa todos objetos en una jerarquía de árbol, con el object estudio como raiz del árbol (ver <xref linkend="studytree-fig"/>). Los objetos de volúmenes de datos serán ramas principales del objeto estudio, mientras que los ROI's pueden ser ramas del objeto estudio o de los objetos de volúmenes de datos. Por qué es esto importante. Porque la estructura del árbol determina como los movimientos son seguidos por el programa. Si un volumen de datos es movido con respecto al resto del estudio, los ROI's que son ramas de ese volumen de datos son movidos acordemente con aquel, así se mantendrá la correcta orientación y posión con respecto al volumen de datos padre.

en: Real World Units
es: Unidades del mundo real

en: An important thing to realize when working with AMIDE is that the program will try to abstract away the underlying digital format of the data as much as possible. When you listen to digital audio, the CD player automatically converts the series of 0's and 1's encoded on the compact disc into an analog format so that you don't have to worry about the underlying digital format. Similarly, AMIDE presents the digital data to you in analog form. When ever possible, units are given in terms of real world units (e.g. mm's, seconds), and most operations are not constrained by the discrete nature of the underlying data. For example, data in AMIDE is viewed in terms of "slices", not fixed image planes. These slices can be taken from the data set at arbitary angles, and can be of any thickness (they are not constrained to be integer multiples of the underlying voxel size). You may be used to looking at medical images in terms of voxels and integers, but remember that the object or subject scanned is an item in the real world, and AMIDE tries to recreate this "analog signal" for you.
es: Es importante darse cuenta trabajando con AMIDE que el programa intentará abstraer el formato de sobreimpresión digital tanto como sea posible. Cuando eschucha un CD de audio, el reproductor convierte automáticamente una serie de ceros y unos codificdos en el disco en formato digital, y así usted no tiene que preocuparse del formato digital subyaccente. De manera similar, AMIDE presenta los datos digitales de forma analógica. Siempre que sea posible las unidades empleadas son unidades del mundo real (mm, seg..), y al mayoría de operaciones no estan limitadas por la la naturaleza discreta de los datos subyaccentes. Por ejemplo, los datos son vistos en término de "cortes" y no de planos fijos de imágenes. Estos cortes pueden extraerse del volumen de datos en cualquier ángulo, y con cualquier grosor (no sólo limitado a múltiplos del tamaño del voxel). Usted pude estar acostumbrado a mirar las imágenes médicas en términos de de vóxeles y de enteros, pero recuerde que el sujeto escaneado es parte del mundo real, y AMIDE intentará recrear esta "señal analógica" para usted.

en: The only place the abstraction starts to break down is when dealing with dynamic data sets. Einstein understood time to be a "special" dimension, and AMIDE agrees. The reason for this, is that trying to represent dynamic data as anything but separate frames of data becomes overly complex from a computational standpoint, primarily because dynamic data is generally not equally spaced. While moving 1 voxel in the x, y, or z directions will always move you a constant unit of measurement (say 0.4 mm) in the appropriate direction, moving 1 voxel in the t direction may move you 30 seconds or 30 minutes in time, depending on what frame you're looking at. Because of this, AMIDE deals with dynamic data in terms of frames, although it should always tell you the time that those frames correspond to.
es: El único sitio donde la abstracció empieza a romperse y cuando se trabaja con volúmenes de datos dinámicos. Einstein entendió que el tiempo es una "dimensión" especial, y AMIDE está de acuerdo. La razón de esto es que intentando representar datos dinámicos pero en segmentos de tiempo separados resulta complejo desde el punto de vista computacional, primeramente por que los datos dinánicos no suelen estar igualmente espaciados. Mientras que moverse en el espacio 1 voxel en las direciones x, y o z siempre equivale a una unidad constante de medida (por ejemplo 0.4 mm) en la dirección apropiada, mover un voxel en la dirección t puede ser de 30 segundos o de 30 minutos, dependiendo que segmento de tiempo este mirando. Por esto, AMIDE trabaja con el tiempo en términos de segmentos (frames), aunque AMIDE siempre nos dirá el tiempo al que corresponede cada segmento.

en: Components of the Display
es: Componentes del Display

en: AMIDE Main Window
es: Ventana Principal de AMIDE

en: A diagram pointing out the salient features of the main window
es: Diagrama señalando lo más destacable de la ventana principal

en: Context Sensitive Help
es: Ayuda Sensible al Contexto

en: Located in the lower left corner of the window, the context sensitive help window shows what different mouse buttons and key strokes can accomplish given the current cursor position. Note that mouse buttons are labelled in UNIX fashion. Buttons 1, 2, and 3 correspond to the left, middle, and right mouse buttons, respectively. Under Macintosh OS X, the middle and right buttons are emulated by pressing the option key or the open apple key, respectively, while pressing the mouse button.
es: Localizada en la esquina inferior izquierda de la ventana, la ayuda sensible al contexto mostrará que lo que sucederá al apretar los diferentes botones del ratón o las combinaciones de teclas. Los botones estan marcados a la manera UNIX, correspondiendo el 1, 2 y 3 a izquierdo, medio y derecho respectivamente. En los ratones con sólo dos botones, el del medio es emulado apretando los dos botones a la vez.

en: Tree View of Study Data
es: Vista del Arbol de Datos del Estudio

en: Located on the left side of the window is a tree listing of all the objects in the study. The tree structure shows how movements will be propogated to other objects in the study. For instance, if a data set is rotated, all of its children will be correspondingly rotated.
es: Localizado en la parte izquierda de la ventana esta una árbol que lista todos los objetos del estudio. La estructura de árbol muestra como los movimientos serán propagados a los objetos del estudio. Por ejemplo si un volumen de datos es rotado, todos sus objetos hijos serán rotados acordemente.

en: Objects in the tree can be selected for display by left clicking on the name of the object. Middle clicking on a data set will make that data set the "active" data set. The "active" data set is designated by being highlights, and when a function is chosen that can logically apply to only one data set (e.g. filtering), the active data set is the one chosen.
es: Objetos del árbol pueden ser selecionados con pulsación en el botón 1, en el nombre del objeto. Click en el 2 "activa" el objeto. El "volumen activo de datos" aparecerá remarcado, y cuando se una selecciona una función (por ejemplo un filtro), esta será aplicada sólo al "volumen activo de datos".

en: Object modification dialog boxes can be brought up by right clicking on the corresponding object. ROI's can be added by right clicking on the blank area of the tree, or shift-right clicking on one of the objects. These functions are further described in <xref linkend="data_sets"/> and <xref linkend="rois"/>.
es: Al diálogo de modificación de objetos se pude acceder con el botón 3, haciendo pulsación sobre el objeto, correspondiente. Los ROI's se pueden añadir haciendo pulsación con el botón 1 en un área desnuda del árbol, o con MAYUSCULAS+botón 3 en un objeto. . Estas funciónes se describen con mayor detalle en <xref linkend="data_sets"/> and <xref linkend="rois"/>.

en: Orthogonal Views
es: Vistas Ortogonales

en: Most of the main window display consists of the orthogonal views used for visually displaying the data sets being studied. Data is usually presented as three orthogonal slices taken from the data sets, but the user can choose to display fewer of these views if desired by using the view selector (described below in <xref linkend="view_selector"/>). The three views shown are the transverse, coronal, and sagittal planes. Note that the views may be incorrectly labeled for you. This could be because the data in the file you imported was not in the order that AMIDE expected it to be in. It could also be because you want to use the transverse/coronal/sagittal terminology differently then the program does (e.g. a coronal section of a rat brain is not the same as a coronal section of a rat).
es: La mayoría de la ventana principal corresponde a vistas ortogonales del los volúmenes de datos a visualizar. Los datos usualmente se presentan como tres vistas ortogonales, pero el usuario pude decidir usar menos, usando le selector de vistas (descrito abajo en <xref linkend="view_selector"/>). Las tres vistas mostradas son los planos axial , coronal, and sagital. Nótese que las vistas pueden aparecer incorrectamente marcadas. esto puede ocurrir si si el fichero importado no esta en el orden que AMIDE espera. Podría ser por que usa una terminología diferente de orientación al la del programa (por ejemplo la sección coronal del cerebro de una rata no es la misma orientación coronal de la rata).

en: Below the views are sliders for adjusting where in the data set the slices are being taken from. The location can also be changed by directly clicking on any of the canvases. The appropriate mouse clicks are as follows
es: Bajo las vistas hay barras desplazables para cambiar el lugar de donde las vistas son tomadas. La localización también puede cambiarse haciendo pulsación directamente sobre imagen de la vista. Las pulsacións de ratón apropiadas son:

en: Left Mouse Button
es: Boton 1 del ratón

en: Changes the location in the data set that the slices are taken from, without changing the thickness of the slices.
es: Cambia localización de los cortes sin cambiar su grosor.

en: Middle Mouse Button
es: Boton 2 del ratón

en: Change the location in the data set that the slices are taken from, along with setting the thickness of the slices to the minimum reasonable.
es: Cambia la localización de los cortes, poniendo el grosor de los cortes a un mínimo razónable.

en: Right Mouse Button
es: Boton 3 del ratón

en: Clicking an dragging with this button changes the thickness of the slices without changing the location. The thickness of the viewed slices can also be altered by adjusting the slice thickness setting spin button (see <xref linkend="slice_thickness_setting"/>).
es: Haciendo pulsación y arrastrando sin soltar cambia el grosor de los cortes sin cambiar su localización. El grosor de los cortes también puede alterarse con el botón rotatorio de ajuste de grosor de corte (ver <xref linkend="slice_thickness_setting"/>).

en: Other
es: Otras

en: Additional functionality of the mouse buttons for manipulating data sets and ROI's is explained in <xref linkend="data_sets"/> and <xref linkend="rois"/>
es: Funcionalidades Adicionales de los botones del ratón se explican en <xref linkend="data_sets"/> y <xref linkend="rois"/>.

en: View Selector
es: Selector de Vistas

en: Which of the three orthogonal views are shown can be selected by using these toggle buttons. By default, all three views are shown.
es: Cual de las tres vistas ortogonales se puden selecionar usndo esos botones. Por defecto las tres son mostradas.

en: Linked Viewing
es: Visión Sincronizada

en: In addition to the three orthogonal views, AMIDE can display mutiple sets of these orthogonal views, all looking at the same point ("linked") in three dimension space. This is most often used for looking at fusion images of two data sets, with one set of views used for the first data set, the next set of views used for the second data set, and the third set of views used for the fusion of the two data sets.
es: Además de esas tres vistas, AMIDE pude mostrar múltiples conjuntos de vistas ortogonales, todos mirando al mismo punto ("sincronizado") del espacio 3D. Esto se usa más a menudo para ver la fusión de dos volúmenes de datos, con un grupo de vistas del primer volumen, y el siguiente usado para el segundo, y el tercero para la fusión de los dos volúmenes.

en: Thresholding Tool
es: Herramienta de Cambio de Umbral

en: This button on the toolbar will pop-up a thresholding and colormap selection dialog for the currently active data set. In the dialog, the maximum and minimum thresholding levels can be changed by either directly typing in the values (in absolute or percentage units), or by using sliders on the color bar. The color scale can be changed using the corresponding drop-down menu. A log normalized histogram is shown to give an idea of the distribution of the data set's value. Finally, the thresholding type can be changed. The thresholding type determines how the maximum and minimum threshold values are applied to the data set, and are:
es: Este botón en la barra de herramientas lanza el selector de mapas de color del volumen de datos activo. En el diálogo, los niveles máximos y mínimos de umbral pueden cambiarse directamente escribiendo los valores (en unidades absolutas o porcentage) , o usando las barras de desplazamiento en la brara de color. La escala de color se puede cambiar usando el correspondiente menú desplegable. Un histograma normalizado da una idea de la distribución de los valores del volumen de datos. Finalmente el tipo de umbral se puede cambiar. El tipo de umbral determina como los valores de umbral mínimos y máximos se aplican al conjunto de datos, y son:

en: Per Slice
es: Por Corte

en: The max and min threshold values will be applied in proportion to the max and min values in the current slice of data
es: Los valores mínimos y máximos se aplicarán en proporción al corte selecionado.

en: Per Frame
es: Por Marco

en: The max and min threshold values will be applied in proportion to the max and min values in the current frame of the data set
es: Los valores mínimos y máximos se aplicarán en proporción al segmento de tiempo selecionado.

en: Interpolate Between Frames
es: Interpolación entre Segmentos de Tiempo

en: This threshold mode only makes sense for dynamic studies. In this mode, two sets of max and min threshold values are specified, along with which frame of data each of these sets corresponds to. For data frames before and including the first reference frame, the first set of threshold values are used. For data frames after and including the second reference frame, the second set of threshold values are used. For data frames between the two reference frames, the max and min threshold values are derived by interpolating (as a function of time) between the two sets of thresholding values.
es: Este umbral sólo tiene sentido para estudios dinámicos. En este modo dos pares de valores máximos y mínimos son selecionados para cada segmento de tiempo. Para cada segmento anterior e incluyendo el primer segmento seleccionado se usa el primer par de valores. Para el segmento segundo y subsiguientes se aplica el segundo par de valores. Para los segmentos incluidos entre el primer y segundo segmentos seleccionados los valores máximos y mínimos son interpolados como función del tiempo entre los dos pares de valores establecidos.

en: The max and min threshold values will be applied in proportion to the max and min values in the entire data set
es: Los valores mínimo y máximos serán aplicados en proporción al los valores mínimos y máximos del conjunto total de datos.

en: Zoom Selector
es: Selector de Zoom

en: This specifies how much to enlarge the views. AMIDE tries to make an educated guess about how large the display of the data should be, by using the smallest voxel dimension from the data set with the largest voxels to correspond to a displayed pixel. Zoom can be used in addition to that guesswork.
es: Este especifica cuanto se magnificarán las vistas. AMIDE intenta hacer una educada adivinanza de cuan grande han de ser las imágenes usando la dimensión más pequeña con los vóxeles más grandes correspondiendo al pixel representado. El zoom se pude utilizar en adicció a esto.

en: Slice Thickness Setting
es: Ajuste del Grosor de Corte

en: Thickness specifies how deep the slices displayed on the views are. The minimum slice thickness is determined by the smallest voxel dimension of any of the data sets in the study.
es: El grosor especifica cómo de profundas han de ser la vistas representadas. El grosor de corte mínimo viene determinado por la dimensión del voxel más pequeño del conjunto de datos.

en: Frame Selector
es: Selector de Segmentos de Tiempo(Frames)

en: This button pops up a dialog for picking which frames of data to show from a dynamic data set. A frame (i.e. time period) to display can be selected by clicking on a list element. Multiple frames can be selected by holding down the shift key and selecting additional frames. Note, that for each data set selected for view, at least one frame from that data set will be displayed. If the choosen time period does not encompass a frame from that data set, the closest appropriate frame will be choosen.
es: Este botón abre un diálogo para seleccionar el segmento a mostrar de un conjunto de datos dinámicos. Un segmento (p.e. periodo de tiempo) para mostrar puede ser seleccionado haciendo pulsación en una lista de elementos. Múltiples segmentos puden ser seleccionados a la vez con pulsación y simultáneamente apretando la tecla MAYUSC para seleccionar segmentos adicionales. Nótese que por cada conjunto de datos seleccionados al menos un segmento será visulaizado. Si elige un periodo de tiempo que no incluye un segmento de tiempo de ese conjunto de datos, el segmento más aproximado será elegido.

en: Target Selector
es: Selector de Puntero(Target)

en: The target cross hairs are generally only displayed when one of the mouse buttons is depressed. With this toggle button, you can tell the program that you want the target cross hairs left on the views.
es: El puntero en forma de cruz generalmente sólo resulta visible cuando apretamos un botón del ratón. Con este botón la cruz permanece siempre visible.

en: Interpolation
es: Interpolación

en: Interpolation refers to the method whereby AMIDE extracts data from the original medical imaging data set in order for it to be viewed on the screen. The interpolation selection button lets the user specify what type of interpolation to use when generating slices from the active data set. Nearest neighbor is faster, while tri-linear interpolation produces better looking (smoother) images with the penalty of being ~8x slower.
es: Interpolación se refiere al método con el que AMIDE extrae datos del conjunto de datos de imagen médica original para ser representados en pantalla. El botón que seleciona la interpolación permite al usuario especificar que tipo de interpolación usar para generar cortes del volumen activo de datos. "Nearest neighbor" es el más rápido, pero tri-línear produce imágenes de mejor aspecto, con la penalización de que es casi 8 veces más lento.

en: Fusion/Overlay Selector
es: Selector Fusión/Sobreimpresión

en: By default, AMIDE displays multiple data sets as fused images. With the fused/overlay selector, you can tell AMIDE that you want the active data set to simply be overlayed on the other data sets, rather than fused.
es: Por defecto AMIDE muestra múltiples volúmens de datos como imágenes fusionadas. Con el selector fusión/sobrimpresión(fused/overlay) usted elige si quiere mejor los volúmenes sobreimpresiónados mejor que fusionados.

en: Preferences Dialog Box
es: Diálogo de Preferences

en: Underneath the edit menu is the preferences menu item. This will pop-up a dialog box that allows you to change preferences as to how things in AMIDE are displayed. The preferences will be saved in a configuration file for use by future AMIDE sessions (note: saved preferences are not currently supported on MS Windows).
es: Debajo del menú de Edición esta el de preferencias. Este desplegará un menú de como las cosas deben de ser mostradas por AMIDE. Las preferencias se guardaran in un fichero de configuración para su futuro uso en AMIDE.

en: ROI/View Preferences
es: Preferencias de Dibujo de ROI

en: Here are several preferences for changing how ROI's are the view canvas are drawn, more thoroughly described in <xref linkend="study-dialog"/>. Note that these preferences are only used when a new study is created. To change these preferences for an existing study, you need to use the study modification
es: El grosor de la línea para dibujar ROIs pude ser cambiado aquí. El grosor oscila entre 1 y 5 pixel.

en: Threshold Windows
es: Preferences de la Disposión de las Vistas

en: The window preferences are more throughly described in <xref linkend="data-set-dialog"/>. Note that these preferences are only used for new data sets. To change the window levels for an existing data set, use the data set modification dialog.
es: La primera opción le permite usar tres vistas (axial, coronal y sagital) con un estilo lineal usualmente usado por los software de PET, y un estilo ortogonal usado por el software de RNM. La segunda opción le permite fijar si el tamaño de la vista ha de permenecer constante o no. Si no esta activada, el tamaño de las vistas mostradas dependerá sólo de los volúmenes seleccionados. Si esta activada, el tamaño del las vistas dependerá de todos volúmenes del estudio. La opción final es para ajustar el tamaño del área vacía en medio del puntero (la cruz mostrada cunado se cambia la localización de la vista)

en: Default Colortable Preferences
es: Preferencias de las Tablas de Color

en: The program uses the specified color tables by default on a newly imported data set.
es: El programa usa por defecto la Tabla de Color del conjunto de datos más recientemente importado.

en: Misc. Preferences
es: Misc. Preferencias.

en: With the "Don't Prompt for 'Save Changes' on Exit" option, you can tell the program to not prompt you to save changes done on the study when exiting an AMIDE session.
es: Con la opción "Don't prompt for 'save changes' on exit" No notificación para guardar los cambios al salir, evitará que AMIDE le notifique al salir del programa si quiere gurdar los cambios.

en: The 'Save .XIF file as directory' option allows AMIDE's XIF file's to be saved in a directory structure, instead of as a single flat file (the default). This option is of interest mainly to developers
es: La opción segunda 'save .XIF file as directory' (Guarde fichero .XIF como directorio) permite que el fichero de AMIDE XIF se guarde como una estructura de directorio y no como un fichero plano (por defecto). Esta opción intersa sobre todo a los desarrolladores.

en: Importing Data and Saving Studies
es: Importando Datos y Guardando Estudios

en: Importation of Data Sets
es: Importación de Conjuntos de Datos

en: AMIDE uses its own format (described below: <xref linkend="xif-files"/>) for saving data between session. To get new data into AMIDE, it needs to be imported (located under the file menu). You can either let AMIDE try to guess the file format (which works for most data types) or tell AMIDE explicitly which format the file to be imported is suppose to be in. Importing of all data types except for raw data is done using Erik Nolf's <ulink type="http" url="http://xmedcon.sourceforge.net">(X)medcon</ulink> medical imaging conversion library.
es: AMIDE usa propio formato (descrito abajo: <xref linkend="xif-files"/>) para guardar datos entre sesiones. Para cargar datos al AMIDE, es necesario importarlos (localizado bajo el menú "File" ). Puede optar entre que AMIDE adivine el formato ( funciona para la mayoría de los tipos) o decir a AMIDE explícitamente que formato de fichero debe importar. Importando todos los tipos de datos excepto datos crudos(raw) se hace a través de la librería de conversión medica de Erik Nolf's <ulink type="http" url="http://xmedcon.sourceforge.net">(X)medcon</ulink>.

en: Raw Data Files
es: Ficheros de datos crudos (raw data)

en: AMIDE will generally attempt to load any file ending in ".dat" or ".raw" as a raw data file. The user will be prompted for the dimensions of the study, the offset of the data in the file, and the data format of the data in the file. Both big endian, little endian, and PDP endian files can be loaded (endian refers to the order in which bytes are arranged in memory).
es: AMIDE intentará cargar cualquier fichero que tenga el sufijo ".dat" or ".raw" como fichero de datos crudos. Al usuario se le pedirán las dimensiones , los bits que existen desde el pricipio del fichero hasta los datos, y el tipo y formato de datos. Ficheros en big endian, little endian, y PDP pueden ser cargados (endian se refiere al orden en que los bits son dispuestos en la memoria).

en: The following data formats are supported: 8 bit signed or unsigned integer, 16 bit signed or unsigned integer, 32 bit signed or unsigned integer, 32 bit IEEE floating point, 64 bit IEEE floating point, and ASCII data.
es: Los siguientes formatos de datos son soportados: enteros con o sin signo de 8 bit , 16 , enteros con o sin signo de 32 bit , coma flotante de 32 bit IEEE , coma flotante de 64 bit IEEE , y datos ASCII .

en: Static and dynamic ECAT 6.4 and 7.2 files are supported through (X)MedCon. AMIDE will generally try to load any file ending in ".img" as ECAT 6.4, and any file ending in ".v" as ECAT 7. Please note that ECAT 6.4 files are very difficult to autodetect, so if the file does not end in .img, you will probably have to tell AMIDE explicitly to import the file as ECAT 6.4.
es: Ficheros ECAT 6.4 y 7.2 , tanto estáticos como dinámicos se soportan a través de (X)MedCon. AMIDE intentará cargar cualquier fichero que tenga el sufijo ".img" como el ECAT 6.4, y cualquier fichero con sufijo ".v" como el ECAT 7. Por favor nótese que los ficheros ECAT 6.4 son muy difíciles de autodetectar , así si el fichero no acaba en .img tendrá que comunicar explícitamente a AMIDE para que importe el fichero como ECAT 6.4.

en: Although not compiled in by default, AMIDE can be configured to use the z_matrix_7/libecat library for handling ECAT files instead of (X)MedCon.
es: Aunque no se compila por defecto, AMIDE se puede configurar para usar la librería z_matrix_7/libecat para el manejo de ficheros ECAT en vez de (X)MedCon.

en: DICOM Files
es: Ficheros DICOM

en: DICOM 3.0 is supported through (X)MedCon, which actually uses a slightly modified version of Tony Voet's VT-DICOM library. The level of support for DICOM 3.0 is entirely determined by (X)MedCon/VT-DICOM.
es: DICOM 3.0 se soporta con (X)MedCon, el cual tiene una librería ligeramente modificada de Tony Voet's VT-DICOM . El nivel de soporte de DICOM 3.0 viene enteramente determinado por (X)MedCon/VT-DICOM.

en: DICOM data is often distributed as a series of single slice data files. To read these into AMIDE as a single data set, you will need to stack these slices into a single, volumetric file. Notes on how to do this can be found at <ulink type="http" url="http://xmedcon.sourceforge.net/faq/stack.html">the (X)medcon website</ulink>.
es: Los datos DICOM normalmente aparecen distribuidos en un grupo de ficheros. Para que los lea AMIDE como un conjunto único de datos, necesitará agrupar esos ficheros en un único fichero de todo el volumen. Notas de cómo hacer esto se encuentran en <ulink type="http" url="http://xmedcon.sourceforge.net/faq/stack.html">el website de (X)medcon. </ulink>.

en: Concorde format files are generated by the Concorde company's series of microPET scanners. It's a two file format (a data file and a header file), with the header in easily read ASCII format. Please note that you will need to tell AMIDE to open the header file (.img.hdr), not the raw data file (.img).
es: Los ficheros Concorde son generados por los tomógrafos de microPET de la compañía Concorde. Es un formato con dos ficheros (uno de datos y otro de encabezamiento), con el de encabezamiento fácilmente leíble en ASCII. Usted tendrá que decir al AMIDE que abra el fichero de encabezamiento (.img.hdr), no el fichero de datos (.img).

en: A variety of additional file formats are supported through (X)MedCon, including: Acr/Nema 2.0, Analyze (SPM), InterFile3.3, and Gif87a/89a. For more information, please see the (X)MedCon documentation, or the corresponding <ulink type="http" url="http://xmedcon.sourceforge.net"> webpage (http://xmedcon.sf.net) </ulink>.
es: Una variedad de formatos adicionales pueden ser soportados a través de (X)MedCon, incluyendo: Acr/Nema 2.0, Analyze (SPM), InterFile3.3, y Gif87a/89a. Para mas información , por favor refiérase a la documentación de (X)MedCon <ulink type="http" url="http://xmedcon.sourceforge.net">sitio web (http://xmedcon.sf.net)</ulink>.

en: XIF Files
es: Ficheros XIF

en: AMIDE saves studies in an extensible XML based format called XIF (Xml Image Format). This format can be stored as either a single file (flat file format XIF) or as a XIF directory. The flat file format is the default, and simplifies file moving and handling. The directory format on the other hand allows easy access to the raw study data external to the AMIDE program, and will be of interest to developers. Which of these two formats you wish to save in can be selected from the preferences dialog.
es: AMIDE guarda los estudios en un formato extensible XIF (Xml Image Format). Este formato puede guardarse como fichero (formato plano XIF) o como un directorio XIF . El formato por defecto es el plano, lo que simplifica el manejo y movimiento de los ficheros. Por otro lado el formato en directorio permite el fácil acceso a los datos del estudio AMIDE por parte de otros programas, lo que será de interés para los desarrolladores. En el diálogo de preferencias puede elegir cual de los dos formatos XIF usar.

en: In any case, these files or directories will characteristically end with ".xif", and are treated identically within the AMIDE program.
es: En cualquier caso los ficheros o directorios tendrán el sufijo ".xif", y serán tratados idénticamente por el programa AMIDE .

en: Opening Studies
es: Abriendo Estudios

en: From the main window, select "File-&gt;Open", and a file selection widget will open up. Select an XIF filename in the right column, and then hit the "OK" button (or double click on the filename).
es: De la ventana principal, selecciónar "File-&gt;Open", y se abrirá un diálogo de selección. Seleccione un nombre de fichero XIF en la columna de la derecha, y pulse el boton "OK" (o haga click doble en el nombre del fichero).

en: Saving Studies
es: Guardando Estudios

en: To save a study, from the study window select "File-&gt;Save As" and a file selection dialog will appear. Look at the "selection:" line near the bottom of the window, if this is the desired XIF filename, hit "OK" and the file will be saved. If this is not the desired XIF filename, select or enter in the correct XIF study, and hit the "OK" button.
es: Para guardar un estudio, de la ventana de selección de estudios "File-&gt;Save As" y un diálogo de selcción de ficheros aparecerá. Mire la línea "selection:" cerca del pie de la ventana, si este es el fichero XIF deseado , pulse "OK" y el fichero sera guradado. Si no fuera el fichero XIF deseado , seleccione o entre el nombre correcto de estudio XIF, y pulse el boton "OK" .

en: Note that the original data set files are no longer needed by AMIDE, as all the information AMIDE needs is saved inside the .XIF file. You should however still archive the original data files, as AMIDE only reads in and stores the information from the header that it needs (which is generally not all the information enclosed within the header).
es: Note que los ficheros de datos originales ya no son necesraios para AMIDE, ya que toda la información que AMIDE necesita esta guardada en el fichero .XIF . De todas las maneras debería guardar los ficheros originales, ya que AMIDE solamente lee la información que necesita del encabezamiento.

en: XIF Directory Format
es: Formato XIF en Directorio

en: Although admittedly annoying from a data transfer standpoint, using a directory structure for saving study information has the decisive advantage of making the saved information easily accessible using standard command-line utilities and text-based tools.
es: Aunque desde le punto de vista de tranferecia es bastante engorroso, usando la estructura de directorio para guardarlos tiene la ventaja decisiva de hacer la información mas fácilmente accessible usando linea de comandos y herramientas estandar de texto.

en: Each XIF directory contains a file called "study_*.xml" which contains the basic study parameters. Additional files can also be found in the XIF directory, such as ROI_*.xml files which contain ROI's, and data-set_*.xml files and their corresponding data-set_*_raw-data files, which contain the image data set parameters and the raw data respectively. The raw data file format is arbitrary (double/float/int, 64/32/16/8 bit, little or big endian, per plane/per frame/single scale factor), and is determined by the format of the originally imported data.
es: Cada directorio XIF contiene un fichero llamado "study_*.xml" el cual guarda los paramnetros básicos del estudio. Ficheros adicionales se encuentran en el directorio XIF como los ficheros ROI_*.xml que guardan ROI's, y data-set_*.xml con sus correspondientes conjuntos de datos, data-set_*_raw-data files, que contienen los parámetros de imagen y los datos crudos respectivamente. El fichero crudo (raw) (double/float/int, 64/32/16/8 bit, little or big endian, por plano/por segmento de tiempo(frame)/factor simple de escala), y está determinado por el formato original de los datos.

en: XIF Flat File Format
es: Formato Plano XIF

en: The flat file format is basically a concatenation of the information enclosed within the directory format. It is not meant to be editable or developer friendly. Instead, it allows easy manigment of studies for casual users. If you wish to access the information in a XIF flat file external to AMIDE, you'll be much better off resaving the data as in XIF directory format.
es: El formato palno XIF es una concatenación de la información encerrada en el directorio XIF. No es de ninguna manera para ser editado o fácil para los desarrolladores. En cambio, facilita el manejo para los usuarios. Si desea acceder al al información a un fichero palno XIF por un programa externo, mejor vuélvalo a guardar como formato XIF en directorio.

en: The format is as follows: The first 64 bytes of the file contain a magic string for format identification. The next 16 bytes contain 2 64bit unsigned little endian integers, the first one being the location of the study xml data within the file, and the second integer being the size of this xml data. Within the study xml data, is encased the information as to where in the file the children's xml data is. And within the children's xml data, is enclosed the location information of the raw data and subchildren.
es: El formato es el siguiente: Los primeros 64 bits contienen una cadena mágica de identificación del formato. Los siguientes 16 bits contienen 2 enteros de 64 bit little endian, el primero siendo la localización del estudio xml en el fichero, y el segundo correspondiendo al tamaño de los datos xml. Dentro de los datos xml esta incluída la información de donde se hallan ubicados los hijos de los datos xml, y dentro de los datos xml de los hijos se encuentra la localización de los datos de los subhijos.

en: Exporting a View to JPEG/PNG
es: Exportando una Vista a JPEG

en: To export one of the views (transverse/coronal/sagittal) to an external image file, select "File-&gt;Export View-&gt;[view]" from the menu. The saved data format by default is jpeg. If the saved filename ends in ".png", the saved data format will be PNG.
es: Para exportar una de las vistas (transversa/coronal/sagital) a un fichero externo de imagen, seleccione "File-&gt;Export View-&gt;[view]" desde el menú. . La vista será guardada como jpeg.

en: Manipulating Medical Data Sets
es: Manipulando Conjunto de Datos Médicos

en: After being loaded in, medical images can be manipulated in a variety of ways with AMIDE. An important point to remember is that AMIDE deals with all data sets as 3 or 4 dimensional data sets. While 2D slices extracted from the the data set are displayed on the computer screen, at no time does AMIDE handle images as anything less than 3 dimensional data.
es: Despues de ser cargados los datos médicos pueden ser manipulados de varias maneras en AMIDE. Es importante recordar que AMIDE trabaja con volúmenes de datos 3D y 4D. Mientras que los cortes 2D son representados en la pantalla del ordenador , AMIDE maneja siempre datos tridimensionales.

en: Manipulating Data Sets on Screen
es: Manipulando Volúmenes en la Pantalla

en: Displaying Data Sets
es: Viendo Volúmenes

en: When initially loaded into the program, a data set is not displayed on the canvases. Rather, the name of the data set is contained in the study list, and the user needs to select the data set in the study list so that it is displayed on the canvases.
es: Cuando inicialmente se carga un conjunto de datos en el programa este no es visualizado. En vez de esto el nombre del conjunto de datos aparece en la lista del estudio, y el usuario debe seleccionar este conjunto de la lista para visualizarlo.

en: Displaying multiple data sets is as simple as importing more than one data set, and then selecting the data sets that you wish to view from the study list.
es: Ver múltiple conjuntos de datos es tan simple como importar mas de un conjunto de datos, y entonces selecionar que conjuntos queremos ver de la lista del estudio.

en: The time period over which the slices are drawn is determined by the time dialog, described in more detail in <xref linkend="frame-dialog"/>
es: El periodo de tiempo se selecciona del diálogo de tiempo y se describe en mas detalle en <xref linkend="frame-dialog"/>

en: Pertinent Mouse Actions
es: Manejo del Ratón

en: The following mouse actions can be used when the mouse is hovering over a data set on any of the orthogonal views
es: Las siguientes acciones del ratón puden ser usadas sobre los datos de las vistas ortogonales

en: Shift-Left Mouse Button
es: MAYUSC+Botón 1

en: This combination allows shifting of the active data set in space (usually used for aligning two data sets). While holding the shift key, left click (and release) on the canvas, and you'll grab the active data set. You can now shift the active data around on the canvas. At this point, to enact the shift, click the right button (button 3). Any other mouse button will cancel the shift action.
es: Esta combinación permite desplazar el volumen en el espacio (normalmente usado para alinear volúmenes de datos). Mientras se aprieta MAYUSC, al pulsar el el botón 1 en la imagen, se cojerá el volumen activo. Ahora puede desplazarlo alrededor del marco. Cuado el volumen se halla en la posición deseada para soltarlo pulsar el botón 3. Cualquier otro botón del ratón cancelará el desplazamiento.

en: Shift-Right Mouse Button
es: MAYUSC+Botón 2

en: This combination allows rotating of the active data set in space (usually used for aligning two data sets). While holding the shift key, middle click (and release) on the canvas, and you'll grab the active data set. You can now rotate the active data around on the canvas. At this point, to enact the rotation, click the right button (button 3). Any other mouse button will cancel the rotation.
es: Esta combinación rota el volumen en el espacio (normalmente usado para alinear volúmenes de datos). Mientras se mantiene pulsada MAYUSC, pulsar (y soltar) con el botón 2 en la imagen, se cojera al volumen. Ahora puede rotar el volumen activo. En este punto para soltar el volumen, pulsar el botón 3. Cualquier otro botón cancelará la rotación.

en: Ctrl-Right Mouse Button
es: Ctrl+Botón 3

en: This combination will place an alignment point at the current cursor location. A dialog will popup for entry of the alignment point's name.
es: Esta combinación situa un punto de alineación en la posición donde este el cursor. Un diálogo pedirá el nombre del punto.

en: Manually Aligning Data Sets
es: Alineación Manual de Volúmenes

en: What follows is a quick guide to manually aligning data sets in AMIDE
es: Lo que sigue es una guía rápida para alinear manualmente volúmenes en AMIDE

en: First rotate each of the data sets so that they are level with respect to the transverse, coronal, and sagittal views. This is easily done using the shift-2 mouse combination, but can also be done from the data set modification dialog.
es: Primero rotar los volúmenes para que esten a nivel respecto a las vista axiales, coronales, and sagitales . Esto se hace fácilmente con la combinación MAYUSC+2 botón , pero también pude hacerse desde el diálogo de modificación de los conjuntos de datos.

en: Choose one of the data sets to be the active data set. The other data set will be the "fixed" data set.
es: Elija un volumen como activo, este se moverá. El otro permanecerá "fijo" .

en: Shift the active data set so that the two data sets line up appropriately. This is easily done using the shift-1 mouse combination, but can also be done from the data set modification dialog.
es: Desplace el volumen activo hasta alinearlo con el fijo. Esto se hace fácilmente con la combinación MAYUSC+Botón 1 , pero también puede hacerse desde el diálogo de modificación de los conjuntos de datos.

en: If fine tuning adjustments are needed, these are best done from the data set modification dialog.
es: Los ajustes finos es mejor llevarlos a cabo desde el diálogo de modificación de los conjuntos de datos.

en: Data Set Modification Dialog
es: Diálogo de Modificación de Conjuntos de Datos

en: To modify parameters of a data set, right click on the name of the data set in the study tree to pop-up the data set modification dialog box. Parameters that can be modified are divided into the following pages.
es: Para modificar los Parametros de un volumen, pulsar con el botón 3 en le volumen del arbol del estudio para que aparezca el diálogo de modificación. Los parámetros modificables se dividen en las siguientes páginas.

en: On this page are options to alter the data set name, type of modality, subject name, subject id, subject date of birth (DOB), conversion factor, and the interpolation type to use for this data set (described at <xref linkend="interpolation"/>). The conversion factor is a parameter that is multiplied to the data set before it is used for viewing or quantitation. Since the data set is in ECAT/MAP/abitrary scale units, the conversion factor can be used in order to analyze the data set in another type of reference unit (e.g. Percent Injected Dose [%ID]). There is also a built in calculator, where parameters such as subject weight and injected dose can be entered, and the conversion factor will be generated. Note that 1 cc is assumed to equal 1 g when generating the %ID/g and SUV.
es: En esta página hay opciones para modificar el nombre, tipo de modalidad, factor de conversión, y tipo de interpolación usado en este volumen de datos (descrito en <xref linkend="interpolation"/>). El factor de conversión es el parámentro por el que se multipilican el volumen de datos antes de verlo o cuantificarlo. Al estar los datos en una escala arbitraria de valores ECAT/MAP, el factor de conversión se puede utilizar para analizar los datos con otro tipo de unidad d e referencia(p.e. Porcentaje de Dosis Inyectada [%ID]). También hay una calculadora incluida, donde se pueden meter los parámetros como el peso del sujeto y la dosis inyectada, generandos el factor de conversión.

en: Center
es: Centro

en: The data set can be shifted by respecifing the center of the data set with respect to the origin. The x, y, and z dimensions are in millimeters.
es: Se puede desplazar el volumen de datos con respecto al origen de coordenadas. Las dimensiones xyz son en milímetros.

en: Voxel Size
es: Tamaño del Voxel

en: The size of the data set's voxels (again, in millimeters) can be altered on this page. The "keep aspect ratio" button specifies that when altering the size of any voxel component (x, y, or z), the relative sizes between the components should be kept the same.
es: El Tamaño del voxel de los datos (también en milímetros) pude ser alterado en esta página. El botón "keep aspect ratio" especifica que cuando se altera cualquier dimensión del voxel (x, y, or z), las demás dimensiones se alteraran en la misma proporción.

en: Rotate
es: Rotar

en: The data set can be rotated around its center in this page. There is one dial for each of the three slice planes. The transverse dial will spin the data set in the transverse plane (i.e. rotate on the z-axis). The coronal dial will spin the data set in the coronal plane (i.e. rotate on the y-axis). And the sagittal dial will spin the data set in the sagittal plane (i.e. rotate on the x-axis). The "reset to default" button allows the data set to be rotated back to the default orientation. On the bottom of this page is a matrix showing the coordinate frame of the data set with respect to the base coordinate frame.
es: El volumen de datos puede ser rotado sobre su cento en esta página. Hay una ruedecita por cada plano. La ruedecita axial rotará el volumen en el plano transversal (rota sobrel el eje z). La ruedecita coronal rotará el volumen en el plano coronal (rota sobrel el eje y). Y la rudecita sagital lo hará sobre el plano sagital (rota sobrel el eje x). El botón "reset to default" deshace las rotaciones dejando el volumen como al principio. Al pie de página existe una matriz con las tranformaciones de las coordenadas del volumen con respecto al las coordenadas de origen.

en: Colormap/Threshold
es: Mapa de Color/Umbral(Threshold)

en: This page is analogous to the thresholding tool dialog (described at <xref linkend="threshold_dialog"/>) above).
es: Esta página es análoga al del diálogo de Umbral (descrita en <xref linkend="threshold_dialog"/>).

en: Time
es: Tiempo

en: From this page, the timing information of the data set can be altered. Scan start time can be used for altering the start time of the scan with respect to other data sets. Corrections in the duration of each data frame can also be made on this page.
es: Desde esta página se puede alterar la información respecto al los tiempos de los datos. El tiempo de comienzo del scan puede cambiarse con respecto al tiempo de otros scans. También pueden hacerse correciones en la duración de cada marco de tiempo(Frame Time) .

en: This panel lists information about the data set that cannot be altered. The underlying internal data format of the data set and the data set dimensions in voxels are displayed on this page.
es: Este panel lista la información que no puede ser alterada. El formato interno subyaccente y las dimensiones del voxel se muestran en esta página.

en: Using Regions of Interest (ROI's)
es: Usando Regiones de Interés (ROI's)

en: ROI stands for Region of Interest. An ROI designated a volume in space over which statistics should be calculated.
es: ROI(Region of Interést) es decir Región de Interés. Un ROI designa un subvolumen del volumen de datos sobre el que serán calculadas las estadísticas.

en: The following ROI types are currently supported in AMIDE:
es: Lo siguientes tipos de ROI son soportados por AMIDE:

en: Ellipsoid
es: Elipsoide

en: An ellipsoid is similar to a sphere, but with a radius specified for each direction [x,y,z]. In the case of x=y=z, the ellipsoid is a sphere.
es: Un elipsoide es similar a una esfera, pero con un radio que puede ser diferente en cada dirección [x,y,z]. Si x=y=z el elipsoide se convierte en una esfera.

en: Elliptic Cylinder
es: Cilindro Elíptico

en: An elliptic cylinder is similar to a regular cylinder, except it has an ellipse as its base instead of a circle.
es: Similar al cilindro excepto que su base en vez de un círculo es una elipse.

en: Exactly what it says, a 3D box.
es: Caja 3D.

en: Isocontour ROI's
es: ROI Isocontorno

en: Isocontour ROI's are regions selected from the data set such that the edge values of the ROI are always the same value. There are two types, 2D and 3D isocontours. Additionally, both these ROI types can be defined so that they encompass all neighboring values either above a certain minimum value, below a certain maximum value, or between a minimum and maximum value. After drawing of these ROI's, they can be modified by using manual drawing or erasing operations.
es: ROI Isocontorno, son regiones seleccionadas del volumen cuyos límites tienen el mismo valor. Hay dos tipos, isocontronos 2D y 3D .

en: 2D Isocontour
es: Isocontorno 2D

en: A 2D isocontour is derived by considering a value on one of the displayed 2D slices. The depth of a 2D isocontour is specified initially by the depth of the viewed slices.
es: El isocontorno 2D se deriva del dibujado en uno de los cortes. . La profundidad del isocontorno 2D esta determinada por el grosor del corte visualizado.

en: 3D Isocontour
es: Isocontorno 3D

en: A 3D isocontour is derived by considering a value on the current frame of the active data set.
es: El isocontorno 3D se deriva considerando un valor del marco de tiempo selecionado del volumen activo.

en: Drawing ROI's
es: Dibujando ROI's

en: To draw an ROI, you first need to create a new ROI. You can add a new ROI to either the study, or a particular data set. To add an ROI to the study, you can either select the ROI desired under the "Edit-&gt;add ROI:" menu item, or right click on the blank area of the study tree. To add an ROI to a data set, shift-right click on the data set that you'd like to add the ROI to. In both cases, a dialog box will pop-up for you to enter in the new ROI's name.
es: Para dibujar un ROI, primero necesita crear un ROI nuevo. Puede añadir un ROI a todo el estudio o a un volumen en particular. Para añadirlo al estudio, puede seleccionar el ROI en el menu item "Edit-&gt;add ROI:" , o hacer pulsar el botón 3 en el área desnuda el árbol del estudio. Para añadir un ROI a un volumen , hacer SHIF+botón 3 sobre el volumen a añadir. En ambos casos emergerá una cajita de diálogo para entrar el nombre del ROI.

en: When first added, the new (undrawn) ROI will be selected in the study tree. When an undrawn ROI is selected in the study tree, the program will use the next mouse input on any of the displayed views to begin the process of drawing this ROI.
es: Al añirlo al pricipio , el ROI nuevo (todavía no dibujado) sera seleccionado en el árbol del estudio. Cuando un ROI todavia no dibujado es seleccionado, el programa usara el la siguiente acción del ratón sobre una vista para empezar el proceso de dibujo del ROI.

en: For ellipsoid, elliptic cylinder, and box ROI's, a click with the left button will begin an edge-to-edge drawing, while a click with the middle button will begin a center-out drawing. The x and y dimensions of the ROI are determined by this process. The z dimension (thickness) of the ROI can be specified by the pop-up dialog that will appear on the completion of the mouse movement.
es: Para ROI's elipsoide, cilindroide y caja 3D, una pulsación d el botón 1 empezará un dibujo de borde a borde , mientras que si pulsamos el botón 3 empezará el dibujo por el centro. Las dimensiones xy del ROI se determinan con este proceso. La dimensión z (grosor) del ROI se puede especificar en el diálogo que emergerá al acabar de dibujar el ROI.

en: For isocontour's, the value of the data set at the clicked upon location will be used to derive the isocontour.
es: Para los isocontornos, el valor de donde este situado el cursor sera usado para derivar el isocontorno.

en: Manipulating ROI's
es: Manipulando ROI's

en: After an ROI is drawn, it can be further manipulated to adjust its size, placement, and orientation. You can directly manipulate the ROI by clicking on it in any of the viewing windows. Mouse button 1 is used to shift ROIs. Mouse button 2 is used for zooming ellipsoid, elliptic cylinder and box ROI, and is used for entering drawing mode for isocontour and freehand ROI's. Mouse button 3 is used to rotate ellipsoid, elliptic cylinder, and box ROIs, and for redefining the isocontour value for isocontour ROI's.
es: Después de haber dibujado un ROI, puede ser manipulado ajustando su volumen, posición y orientación. Puede manipular directamente el ROI pulsando en cualquiera de las ventanas. El botón 1 se usa para desplazar los ROIs. El botón 2 para rotar los ROIs elpisoides, cilindroides y cajas 3D y en el caso de los ROI de isocontorno para borrar puntos. El botón 3 se usa para hacer zoom de los ROI's elipsoide, cylindro elíptioco y caja 3D, y redefine le valor del isocontrono en el caso de esos ROIs.

en: You can also edit the ROI size/placement/orientation/name etc. by clicking on mouse button 3 while over the ROI's name in the study item list. This brings up the ROI modification dialog (described at <xref linkend="roi-dialog"/>).
es: También puede editar el tamaño,situación, orientación, nombre etc.. pulsando el botón 3 sobre el nombre del ROI en la lista de items del estudio. Esto hace que aparezca el diálogo de Modificación de ROIs (descrito en en <xref linkend="roi-dialog"/>).

en: Calculating Statistics
es: Calculando Estadísticas

en: Statistics on an ROI can be calculated via the "Tools-&gt;calulate ROI statistics" menu item. Choosing this will pop-up a dialog that lets you choose which ROI's (selected or all) and which data sets (selected or all) you'd like to calculate statistics over. You will also have three options as to how you what the values to be calculated.
es: Las estadísticas dentro de un ROI se pueden calcular con el menu item "Tools-&gt;calulate ROI statistics" . Eligiendo este emergerá un diálogo que le permitirá elegir entre que ROI (o todos) y entre que volúmenes (o todos) quiere que se calculen las estadísticas. También pude elegir que se calcule sobre subconjuntos de vóxeles, significando el cálculo sobre el x% de vóxeles con valor máximo del ROI.

en: After hitting execute, the program will crank for a while, and then show the calculated values in a new dialog window. Hitting "Save as" button allows saving these values as a tab separated values (TSV) file. This file should be easily imported into most spreadsheet applications (Excel's a little stupid, you may have to explicitly tell it you're importing a TSV file). Pressing the "Copy" button copies the information into the operating systems clipboard, allowing pasting of the results into other programs. The "Save Raw Values" button allows you to export the underlying raw data values for the ROI's in case you wish to do your own statistical analysis.
es: Despues de pulse 'execute' , ejecutar, tras unos instantes el programa mostrará los valores calculados. Seleccionando "save as" permite guardarlo es un fichero con los valores separados por una tab (TSV). Este fichero debería ser importado fácilmente a cualquier hoja de cálculo (Excel es un poco estúpido, tiene que expecificarle que esta importando un fichero TSV, Tab Separated Values).

en: Gotcha's to ROI calculations
es: Facilidades para los Cálculos de los ROI

en: Variance and Standard Deviation Fallacies
es: Varianza/Std. Dev./Std. Err.

en: Currently, AMIDE generates variance and standard deviation values that may occasionally be of interest to imaging physicists. It is very important to remember, that these numbers represent the noise in the data set, NOT the noise in your experiment.
es: A día de hoy, AMIDE genera valores de varianza/std. dev./std. error que ocasionalmente pueden interesar para los investigadores. Es muy importante recordar , que esos números representan el ruido en los datos, NO el ruido en su experiemento.

en: The variance of an experiment can only truly be measured by taking multiple samples (i.e. performing multiple scans) and calculating the variance between these different samples.
es: La varianza del experimento solo puede ser tomada repitiendo multiples muestras (p.e. haciendo multiples scans) y calculando la varianza entre diferentes muestras.

en: Changing Calculated Volume
es: Cambiando el Volumen Calculado

en: <emphasis>Short story:</emphasis> The calculated volume shown by the ROI statistics dialog is correct. Use this value as the volume of the ROI, not the value you might calculate by hand based on the ROI's dimensions.
es: <emphasis>Historia corta:</emphasis> El volumen calculado mostrado por el diálogo de estadísticas del ROI es correcto. Use este valor como volumen del ROI, no el que podría calcular a man basándose en las dimensiónes del ROI.

en: <emphasis>Long story:</emphasis> AMIDE calculates ROI's by translating the ROI's dimensions into the data set's coordinate space. It then computes statistics for all the data set voxels that are in the ROI. For voxels that lie on the edge of the ROI, AMIDE will subdivide the voxel into a finite number of subvoxels, and calculate over the subvoxels. This approach yields correct statistics, but it is important to realize that the computed ROI is a discrete representation of the specified analytical ROI. So while the true volume of an ellipse is pi*r1*r2*r3, the computed volume of the ellipse in AMIDE will depend on the number of voxels and subvoxels that were determined to lie within the ellipse, which in turn can depend on the orientation of the ROI with respect to the data set in question. Since the computed volume given by AMIDE represents the volume in the data set that was used for the ROI calculation, you will want to use that value (not the real ellipse value).
es: <emphasis>Historia larga:</emphasis> AMIDE calcula el ROI's trasladando las dimensiónes del ROI al las coordenadas del espacio del volumen de datos. Entonces calcula las estadísticas de todos los volúmenes de datos que hay en el ROI. Para los vóxeles que caen en el límite del ROI, AMIDE subdividirá el voxel en un número finito de subvóxeles, y hace el cálculo sobre los subvóxeles. Esta aproximación resulta en estadísticas correctas, pero es importante darse cuenta que el ROI calculado es una representación discretizada del ROI analítico. Así que mientras el verdadero volumen de un elipsoide es pi*r1*r2*r3, el volumen calculado por AMIDE dependerá del número de vóxeles y subvóxeles que se determinan dentro del elipsoide, que a su vez puede depender de la orientación del ROI respecto al volumen de datos en cuestión. Como el volumen dado por AMIDE representa el subvolumen en el volumen de datos para el cálculo del ROI, querrá usar ese valor (no el valor real elipsoide).

en: Explanations of ROI Statistical Values
es: Explicaciones de los Valores Estadísticos de los ROI's

en: Median
es: Mediana

en: This is the median value of all the voxels that are enclosed (partially or totally) within the ROI. For an even number of voxels, the median is defined as the average of the center 2 values.
es: Es el valor de mediana value de todos los vóxeles que estan total o parcialmente incluidos en el ROI. Para un numero par de vóxeles , la mediana se define como el promedio de los 2 valores centrales.

en: Mean
es: Media

en: The mean value of the voxels in the ROI. Voxels that are partially enclosed within the ROI are appropriately weighted.
es: El valor media de los vóxeles del ROI. Los vóxeles parcialmente incluidos en el ROI son proporcionalmente sopesados.

en: Variance
es: Varianza

en: The variance of the voxels in the ROI. This is a weighted variance calculation so that voxels that are partially enclosed within the ROI are correctly handled.
es: La varianza de los vóxeles en el ROI. Esta es de hecho un cálculo de varianza sopesada asi los vóxeles parcialmente incluídos en el ROI son correctamente manejados.

en: Standard Deviation
es: Desviación Estandard

en: The square root of the variance.
es: La raiz cuadrada de la varianza.

en: Standard Error
es: Error Estandard

en: The square root of the variance, divided by the square root of the total number of voxels in (totally or partially) the ROI.
es: La raiz cuadrada de la varianza , dividido por la raiz cuadrada del numero total de vóxeles (total o parcialmente) en el ROI.

en: Minimum/Maximum
es: Mínimo/Máximo

en: The minimum and maximum values for all voxels enclosed totally or partially within the ROI.
es: El valor mínimo y máximo de todos los vóxeles parcial o totalmente incluidos en el ROI.

en: Size
es: Tamaño

en: The volume of an ROI (mm^3). Details as to its calculation are above in: <xref linkend="roi-volume-calculation"/>.
es: El volumen de un ROI (en mm cúbicos). Detalles de este cálculo arriba en: <xref linkend="roi-volume-calculation"/>.

en: The is the sum of the voxel weights, and gives an indication of how large the ROI is in voxel space.
es: Es la suma del peso de los vóxeles, y da una indicación de cuan grande es el ROI en el espacio de vóxeles.

en: Voxels
es: Vóxeles

en: This is the total number of voxels used in calculating the ROI, both partial and total. In contrast to the "Fraction Voxels" measure, the "Voxels" measure gives a better indication of the statistical validity of the mean, variance, etc.
es: Es el número total de vóxeles incluidos calculando el ROI, tanto parcial como totalmente. En contraste a la medida "Fraction Voxels", los "Vóxeles" dan mejor indicación de la valided estadística de la median, varianza, etc ..

en: ROI Modification Dialog
es: Diálogo de Modificación de ROI

en: To directly modify parameters of an ROI, right click on the name of the ROI in the study tree to pop-up the modification dialog. Parameters that can be modified are divided into the following pages.
es: Para modificar directamente los parámetros del ROI, pulsar el botón 3 en el nombre del ROI en el árbol del estudio, para que emerga el diálogo de modificación. Los parámetros que se pueden modificar se dividen en dos páginas. pages.

en: The name and type of ROI can be altered on this page.
es: El nombre y tipo de ROI se puede alterar en esta página.

en: The center of the ROI can be shifted with respect to the origin on this page. The x, y, and z parameters are in millimeters.
es: El centro del ROI puede despalzarse en esta página . Los parámetros xyz estan en milímetros.

en: Dimensions
es: Dimensiones

en: The size of the ROI can be altered from this page. The x', y', and z' dimensions are in millimeters and are orientated with respect to the orientation of the ROI.
es: El tamaño del ROI se puede alterar en esta página. Las dimensiónes x, y, y z estan milímetros y orientadas con respecto a la orientación del ROI.

en: The ROI can be rotated around its center in this page. There is one dial for each of the three slice planes. The transverse dial will spin the ROI in the transverse plane (i.e. rotate on the z-axis). The coronal dial will spin the ROI in the coronal plane (i.e. rotate on the y-axis). And the sagittal dial will spin the ROI in the sagittal plane (i.e. rotate on the x-axis). The "reset to default" button allows the ROI to be rotated back to the default orientation. On the bottom of this page is a matrix showing the coordinate frame of the ROI with respect to the base coordinate frame.
es: El ROI puede rotarse sobre su centro en esta página . Hay una ruedecilla para cada uno de los tres planos. La ruedecilla transversal rotará el ROIen el plano transverso (rota sobre el eje z). La rudecilla coronal rotará el ROI en el plano coronal (rota sobre el eje y). Y la ruedecilla sagital girará el ROI en el plano sagital (rota sobre el eje x). El botón "reset to default" deshace los giros dejando la orientación original. Al pie de esta página hay una matriz que muestra las coordinadas del ROI respecto a las coordenadas de origen.

en: Study Modification Dialog
es: Diálogo de Modificación de Estudio

en: Similarly to the data set and ROI modification dialogs, the study modification dialog can be used to alter parameters relevant to the entire study. Right click on the name of the study in the study tree to pop-up the study modification dialog box. Parameters that can be modified are divided into the following pages.
es: Para modificar los parámetros globales del estudio, pulse el botón 3 del ratón en el nobre del estudio en el árbol del estudio o en la caja de diálogo de modificación de estudio. Los parámetros pueden dividirse de las siguientes categorias.

en: On this page are options to alter the name and creation date of the study.
es: En esta página estan las opciónes para alterar el nombre y fecha de creación del estudio.

en: View Center
es: Ver Centro

en: From this page, the point that the study is currently viewing can be explicitly changed. The x, y, and z dimensions are in millimeters.
es: Desde esta página se pude cambiar expliícitamente el centro desde el cual el estudio es visto. Las dimensiónes xyz son en milímetros. También se pueden cambiar explícitamente. The x, y, and z

en: The entire study (including all objects within it) can be rotated around the view center in this page. There is one dial for each of the three slice planes. The transverse dial will spin the study in the transverse plane (i.e. rotate on the z-axis). The coronal dial will spin the study in the coronal plane (i.e. rotate on the y-axis). And the sagittal dial will spin the study in the sagittal plane (i.e. rotate on the x-axis). The "reset to default" button allows the study to be rotated back to the default orientation. On the bottom of this page is a matrix showing the coordinate frame of the study with respect to the base coordinate frame.
es: El estudio completo(incluyendo todos su objetos) puede ser rotado sobre el centro de vista de la imagen. Hay una ruedecilla por cada vista ortogonal. La ruedecilla axial rota sobre el plano axial (rota sobre el eje z). La ruedecilla coronal rotará el plano coronal (rota sobre el eje y) . Y la sagital rotará sobre le plano sagital(rota sobre el eje x). El botón "reset to default" permite volver a la rotación original del estudio. A pie de página hay una matriz mostrando las coordenadas del estudio con respecto a las de referencia.

en: The width of the line used to draw geometric ROIs can be altered here (1-5 pixels). This parameter is not relevant for isocontour ROI's. For isocontour ROI's, you can choose to have them draw as filled in or hollow.
es: The width of the line used to draw geometric ROIs can be altered here (1-5 pixels). This parameter is not relevant for isocontour ROI's.

en: This panel lists information about the study that cannot be altered. "Voxel dim" is the preferred voxel dimension, this is what the canvas will use as the "basic" voxel dimension, from which the zoom factor is relative too.
es: Este panel lista las características del estudio que no puden ser alteradas. "Voxel dim" es la dimensión preferida del voxel, este será usado como dimensión "básica" del voxel, a la cual el zoom es relativa.

en: Viewing Series of Slices
es: Viendo Series de Cortes

en: Instead of looking at three orthogonal slices through the data set, a series of slices (all of the same orientation) can also be examined. Select: "View-&gt;Series", and a dialog box will come up allowing you to pick which objects you'd like to display on the series viewer, along with if you'd like to display the slices over space, time, or gates. The thickness of the slices are determined at the time the series window is brought up. A slider appears on the top of the window which allows moving through the data set. Note that since slices are cached in memory after being displayed, already displayed slices do not need to be regenerated from the data set and reviewing these slices is significantly faster.
es: En vez de examinar las vistas ortogonales , se pueden observar series de cortes (todos en la misma orientación). Seleccione: "View-&gt;Series-&gt;Space-&gt;[view]" del menú para para extraer la serie de cortes de una misma orientación. Alternativamente, seleccione: "View-&gt;Series-&gt;Time-&gt;[view]" desde el menú para ver un mismo corte a lo largo del tiempo en un estudio dinámico. El grosor de los cortes es el que había antes de deplegar el menu. Una barra de desplazmiento aparecera encima de la imagen para moverse por el volumen de datos. Notese que una vez vistos los cortes quedan en la memoria lo que hace que su revisión sea mucho más rápida.

en: Rendering Data
es: Renderizado de Datos

en: Rendering in AMIDE is accomplished using the <ulink type="http" url="http://graphics.stanford.edu/software/volpack/"> Volpack volume rendering library</ulink>. This software library is both portable, and provides for true volume rendering (as opposed to the surface rendering used by many other libraries and hardware accelerators).
es: El Renderizado en AMIDE se lleva a cabo usando la librería de renderizado de volumenes<ulink type="http" url="http://graphics.stanford.edu/software/volpack/"> Volpack</ulink>. Esta librería de software es portable y , permite renderizado verdadero del volumen (en oposición al renderiazado de superficie usado por otras librerías de software para aceleradoras de hardware).

en: To start a rendering window, select the "View-&gt;Rendering" menu item. A small dialog window will pop-up allowing you to select which objects you'd like rendered, along with some additional options. The first "Set values greater than max threshold to zero" allows you to strip high level voxels out of the rendering process. In general you won't want this, but it might be useful if you have high valued areas in your data set that obscures what you'd like to see. The second option "Accelerate Rendering" tells VolPack to use a faster method for doing the volume rendering. You will in general want to use this option, as it causes a significance performance enhancement (around 10 fold). It does, however, require around 3 fold as much rendering as the non-accelerated option, so if you're running out of memory, you'll want to try to rendering without the acceleration. The third option "Initial opacity functions only density dependent" sets things such that the initial gradient opacity function does not contribute to the rendering. This is useful for data sets (e.g. PET) where one is more interested in having an accurate view of the data, rather than a view where gradients in the data set are highlighted.
es: Para comenzar la ventana de Renderizado, seleccionar los volumenes y ROI's que deseara incluir en el rederizado, y pulse el item del menúg "View-&gt;Rendering" . Se desplegará una pequeña ventana de diálogo con dos opciónes. La primera "Set values greater than max threshold to zero(Poner los valores mayores que max a cero)" permite excluir del proceso los valores máximos. En general no deseará esto, pero prodría ser útil cuando hay valores muy altos que obscurecen zonas que quisiera ver. La segunda opción "Accelerate Rendering(Acelerear Renderizado)" hace que VolPack use un método de aceleración del proceso de renderizado. Obtendrá un aumento de velocidad (sobre 10 veces). Sin embargo requiere aproximadamente tres veces mas de memoria RAM, así si dispone de poca RAM no use esta opción.

en: After hitting "Execute" the program will reslice the data sets and ROI's into a data structure that the volpack library can handle, and then perform some initial renderin gcalculations. For data sets, the <link linkend="interpolation">interpolation type</link> specified for the data set will be used. This whole process will take some time, so be patient. Please also note that, when converting the data set, the data is scaled between the current minimum and maximum threshold, with all data above the current maximum threshold set to the maximum threshold value (or zero, if specified), and all data below the current minimum threshold set to the minimum threshold value. This scaling can be relative to the data set's "Global" maximum and minimum, to the "Per Frame" maximum and minimum, or can be from maximum and minimum values "Interpolated Between Frames". "Per slice" scaling does not make sense in the context of volume rendering, and is interpreted as "Global" scaling.
es: Despues de pulsar "Execute" el programa convertirá los volúmenes y ROI's, al formato utilizado por Volpack y hará los cálculos iniciales de renderizado. Para los volúmenes se utilizará el <link linkend="interpolation">tipo de interpolación</link> especificado. Este procedimiento tarda algo de tiempo , luego sea paciente. Por favor note tambien,que al convertir los volámenes, los datos se escalan entre los límites mínimo y máximos establecidos, luego todos los datos mayores del valor máximo se igualaran al valor máximo y todos los valores por debajo del mínimo se igualaran al mínimo. Este escalado pude ser relativo al mínimo y máximo "Global", al mínimo y máximo "Por Segmento de Tiempo(Frame)" , o al mínimo y máximo "Interpolado Entre Segmentos". El escalado "por Corte" carece de sentido en el contexto de rederizado volumétrico, y sera interpretado como escaldo "Global".

en: When all this is completed, the rendering window should pop-up. Its use is described below.
es: Cuando se finaliza esto se despliega una ventana. Su uso se describe abajo.

en: Rendering Window
es: Ventana de Renderizado

en: Main Rendering Canvas
es: Panel Principal de Renderizado

en: The result of the rendering process is presented on the canvas in the center of the window. This canvas can accept user input to change the orientation of the rendering. Button 1 allows rotating on the x and y axis, and button 2 allows rotating on the z axis.
es: El resultado del renderizado se representa en el centro de la ventana . Esta ventana permite la interacción con el usuario. El botón 1 permite rotar en el eje xy , y el botón 2 permite rotar en el eje z.

en: Spin Sliders
es: Barras de Giro

en: You should notice two slider type widgets, one on top of the rendered image, and one on the right side. These are both appropriately labeled with the axis around which the rendering will be spun if they are changed. Additionally you should notice a dial widget (labeled 'z'). The dial is for rotating on the z axis (which comes out of the plane of the display). Note that the effect of rotations are cumulative.
es: Existe dos barra de desplazamiento, una encima de la imagen renderizada, y otra en el lado derecho. Estas estan marcadas apropiadamente con el eje sobre el cual rota el volumen. Adicionalmente existe una rudecilla marcada con la 'z'. esta ruedecilla es para rotar sobre el eje z, que es el perpendicular a la imagen. Nótese que los efectos de rotación son acumulativos.

en: This button will reset the rendering's orientation back to the default orientation.
es: Este botón situará el volumen en su posición original.

en: Toolbar
es: Barra de Herramientas

en: Transfer Function Button
es: Botón de Función de Transferencia

en: This will pop-up a dialog with a panel for each object being rendered. The available options are described below:
es: Este desplegará un diálogo con las opciónes abajo descritas:

en: Return Type
es: Tipo Retornado

en: This setting determines whether the rendering returns an image which looks more analogous to an x-ray (the "opacity" setting), or returns an image which looks more like a surface (the "grayscale" setting). The "grayscale" setting does this by specifying a light source, material properties, and using depth cueing.
es: Este determina si el renderizado sera mas análogo a una radiografía (the "opacity" setting), o mas pareciado a una superficie (the "grayscale" setting). El "grayscale" hace esto especificando la iluminación, el material y usa indicación de profundidad.

en: Color Table
es: Tabla de Color

en: The color table of each rendered object can be changed here.
es: Aquí se puede cambiar la tabla de color de cada volumen renderizado.

en: Classification Functions
es: Funciones de Clasificación

en: This is the most confusing part of rendering, so hang on here. The classification functions are used to map between the value in each voxel and how much that voxel should be represented in the final rendered image. On the x axis is the possible values of the different voxels. On the y-axis is the opacity that will be given a voxel based on its value.
es: Esta el la parte más confusa del renderizado. Las funciónes de clasificación se usan para la correspondencia entre el valor de cada voxel y su representación final en el renderizado. El el eje x son posibles valores de diferentes vóxeles. En ele eje y es la opacidad lo que otorgara el valor en función del valor del voxel.

en: Both classification functions have several buttons on the right side of their graphs. The top button allows the classification function to be drawn as a spline. The second button allows the classification function to be drawn as a series of straight lines. Finally, the last button resets the classification function to a straight line.
es: Las funciónes de clasificación tiene varios botónes a la derecha de sus gráficas. El botón de arriba permite dibujar la función como segmentos curvos. El segundo permite dibujar la función como varias segmentos rectos. Finalmente el último dibuja de nuevo la linea recta inicial.

en: There are two classification functions:
es: Hay dos funciónes de clasificación:

en: <emphasis>Density Dependent:</emphasis> This function tells you how opaque each voxel will be based on its current value. In a sense, this is analogous to an x-ray, where the amount of the x-rays that are absorbed in a structure is related to the density of that structure. of the display.
es: <emphasis>Dependientes de la Densidad:</emphasis> Esta función dice cuan opaca es en fución del valor del voxel. De alguna manera , tiene analogía con los rayos X , donde la cantidad de rayos X absorbidos depende de la densidad de la estructura.

en: <emphasis>Gradient Dependent:</emphasis> Instead of relating the density of a voxel to its opacity, this function relates the gradient of a voxel (how much the value changes between this voxel and its neighbors) to its opacity. This has the effect of giving added weight to surfaces.
es: <emphasis>Dependiente del Gradiente: </emphasis> En vez de relacionar la opacidad con la estructura, esta función depende la opacidad del gradiente entre vóxeles (es decir cuanto cambia el valor de un voxel con respectoa sus vecinos). Este tiene un efecto de realzar las superficies.

en: Monoscopic/Stereoscopic Buttons
es: Botón Monoscópico/Estereoscópico

en: You can choose between generating a single rendered image (monoscopic), or a stereoscopic image pair. A stereoscopic image pair is a pair of images that have been generated at slightly different angles. When viewed correctly, these two images can be interpreted by the viewer's eyes as a single image containing depth information.
es: Puede elegir entre renderizar una imagen única (monoscópica), o un par de imágenes esteroscópicas. Un par esteroscópico de imágenes es cuando se generar a un ángulo ligeramente diferente la una de la otra. Cuando se las mira de manera adecuada pueden ser percibidas por el observador como una imagen única tridimensional.

en: Determines the size at which the resultant rendered image will be displayed. Note that changing the zoom will not affect the speed of the rendering, and increasing the zoom past 1 will not increase the resolution of the rendered image.
es: Determina el tamaño de la imagen resultante renderizada. Nótese que el cambio de zoom no afecta a la velocidad de renderizado, e incrementando por encima de factor 1 de zoom tampoco se incrementara la resolución de imagen renderizada.

en: This menu item allows you to export the rendered image to an external image file. The saved data format is jpeg.
es: Este menú le permite exportar la imagen renderizada a un fichero con formato jpg.

en: This causes the movie generation dialog box to pop up. This dialog box is further described below: <xref linkend="rendering-movie-dialog"/>.
es: Este causa el despliegue de la ventana de generación de video. Este diálogo se describe en mayor detalle abajo: <xref linkend="rendering-movie-dialog"/>.

en: This causes the rendering parameters dialog box to pop up. This dialog box is described below: <xref linkend="rendering-dialog"/>.
es: Este despliega el diálogo del parámetros del renderizado. Este dialogo se describe abajo en: <xref linkend="rendering-dialog"/>.

en: Rendering Parameters Dialog
es: Diálogo de los Parámeters de Renderizado

en: Speed versus Quality
es: Velocidad vs. Calidad

en: With this drop-down menu, the user can choose between rendering speed and rendering quality. To increase speed, voxels with values either close to zero or close to unity can be counted as completely translucent or completely opaque, respectively. The highest quality doesn't use this approximation at all, the lowest quality setting uses this approximation big-time.
es: Con este menúg desplegable el usuario puede elegir la velocidad y calidad del renderizado. Para incrementar la velocidad, los vóxeles cuyos valores sean el máximo y el mínimo, seran tratados como totalmente opacos o translúcidos respectivamente. La mayor calidad en cambio no usa esta aproximación, la menor calidad si.

en: Stereosopic parameters
es: Parámetros Estereoscópicos

en: These parameters are used for controlling the results when the "stereoscopic" option has been chosen.
es: Estos parámetros son usados para controlar el resultado cuando se ha elegido la opción "estereoscópica".

en: This is the angle offset (in degrees) between a pair of rendered images. Increasing this number will generally give a greater sensation of depth in the image pair. A Reasonable value for this parameter is between 2 and 5 degrees. Note that this parameter will be saved between different sessions of the program (not currently done on MS Windows).
es: este es el angulo (en grados) entre el par de imágenes renderizadas. Incrementándolo dara mas sensación de profundidad. Un valor razonable para este parámetro es de 2 a 5 grados. Este valor se puede guardar entre diferentes sesiones.

en: Ideally, this should be (roughly) the distance between the two rendered images, and corresponds to the distance between the user's eyes. It is impossible for a person to resolve a stereoscopic pair if the images are farther apart then the person's eyes, since human eyes cannot move independently. While this parameter is specified in millimeters, the actually distance between the pair of images that gets displayed on the monitor depends on the setup of the computer. If the monitor information reported by the operating system is not correct (usually the case), the "eye width" parameter will not be in true millimeters. Note that this parameter will be saved between different sessions of the program (not currently done on MS windows).
es: Idealmente correspondería a la distancia entre los ojos del observador. Aunque este parámetro está especificado en miliímetros, la distancia real entre las dos imágenes depende de el ajuste de pantalla de cada ordenador. Si la información del monitor que tiene el sitema ioperativo (que normalmente es el caso), the "eye width" el parámetro no estara realmente en milímetros. este parámetro pude ser guardado entre sesiones.

en: Depth Cueing
es: Indicación de Profundidad(Depth Cueing)

en: These parameters are only used if the "grayscale" output type has been chosen.
es: Este parámetro sólo se usa cuando los resultados son "en escala de grises".

en: Enable/Disable Depth Cueing
es: Permitir/Anular Depth Cueing

en: Specify whether or not we want depth cueing. Depth cueing puts in a "fog" that causes more distant voxels to appear less bright.
es: Especifica si queremos o no 'Depth cueing'. Depth cueing pone una "niebla" que ocasiona que los vóxeles mas distantes aparezcan menos brillantes.

en: Front Factor
es: Factor Frontal(Front Factor)

en: This is the transparency of the fog at the front of the data set. If this number is greater than 1.0, voxels toward the front of the data set will be brightened. If this parameter is less than 1.0, voxels toward the front of the data set will be darker, respectively.
es: Es la transparencia de la niebla que se halla por delante del volumen. Si es un número mayor que 1.0, los vóxeles de delante del volumen apareceran mas brillantes. Si fuera menor que 1.0, los vóxeles de delante del volumen apareceran mas obscuros.

en: Density
es: Densidad

en: This is how thick the "fog" is. The thicker the fog, the darker distant objects seem.
es: Es cuan gruesa el la "niebla" . A mayor grosor de niebla los vóxeles aparecen más obscuros.

en: Rendering Movie Dialog
es: Diálogo de Animación del Renderizado

en: How many frames should be in the MPEG1 movie. The MPEG1 movies generated will be set to run at 30 frames/second, so the default of 300 frames will give a ten second movie.
es: Cuantas imágenes debería haber en el video MPEG1 . Los MPEG1 se generan a 30 imágenes/segundo, así el valor por defecto, 300 imágenes dará un video de 10 segundos de duración.

en: Rotations on [x,y,z]
es: Rotatciones en [x,y,z]

en: This setting determines how many times the data set will be rotated around the given axis over the course of the movie. The rotation for each frame is done in x-&gt;y-&gt;z order (rotate on x first, then y, then z).
es: Esto determina cuantas vueltas sobre un eje dado ocurrirán a lo largo del video. La rotación de cada eje sigue este orden x-&gt;y-&gt;z (rota primero x , luego y, y al final z).

en: Dynamic Movie: No/Over Time/Over Frames Smoothed/Over Gates
es: Static/Over Time/Over Frames

en: Note that every time a frame boundary in the data set is passed over, the rendering process must slice and load in a new frame of data. This makes creating a rendered movie over time significantly slower than a movie with just rotations.
es: Nótese que cada vez que se atraviesa un marco de tiempo del volumen, el proceso de renderizado debe de cargar y prepara otro marco de tiempo. Esto hace que crear un video de renderizado dinámico es significativamente mas lento que crear un video solo con rotaciones.

en: Picking "over time" will allow entry of a start and end time for which the data from the data sets should be drawn. With the "over time" option, each second is given equal waiting in terms of how many images from that time period are generated for the output movie.
es: Esta opción permite la creación de un video de un estudio dinámico. Seleccionando "over time" le permitiría definir el tiempo de inicio y finalización dentro del volumen dinámico. Con la opción "over time", cada segundo es igual en terminos de cuantas imágenes de ese periodo de tiempo seran generadas para el video.

en: Picking "over frames" allows entry of a start and end frame (note that this really only makes sense with a single data set). The advantage of "over frames", is that each frame is weighted equally in terms of how many images are generated for the output movie, so for data sets were the dynamics of interest correspond closely to the dynamics of the data set framing sequence, "over frames" may give a more appealing result.
es: Seleccionando "over frames" permite la la entrada de la primera y última imagen (esto sólo tiene sentido cuando se trata de un volumen único). La ventaja de la opción "over frames", es que cada marco de tiempo repercute por igual en el video final, asi cuando la dinámica de interés corresponden a la dinámica de la secuencia del marcos de tiempo del volumen, dando un resultado mas atractivo.

en: Additional Tools
es: Herramientas Adicionales

en: Alignment Wizard
es: Herramienta de Alineamiento(Alignment Wizard)

en: In addition to manually aligning data sets (described at <xref linkend="manual_alignment"/>), data sets can also be aligned using the alignment wizard. The process is basically:
es: En adición al alineamiento manual (descrito en <xref linkend="manual_alignment"/>), los volúmenes tambien pueden alinearse con el "alignement wizard". El proceso es básicamente:

en: Draw at least three pairs of fiducial makers between the two data sets that you wish to align. Drawing fiducial markers is described below as <xref linkend="fiducial-marker"/>.
es: Dibujar al menos 3 pares de puntos fiduciales en los volúmenes que desee alinear. El dibujo de puntos fiduciales se describe debajo como <xref linkend="fiducial-marker"/>.

en: Run the alignment wizard (under tools-&gt;alignment wizard). For the alignment wizard to recognize two fiducial markers as a pair, they must have exactly the same name. So if you have a marker labeled "1" under the first data set, you will need another marker, also labeled "1", under the second data set.
es: Corra el "alignment wizard" (bajo tools-&gt;alignment wizard). para que el "alignment wizard" reconozca 2 marcadores fiduciales como par, deben de tener exactamente el mismo nombre. Así si tiene un marcador llamado "1" en el primer volumen, tendrá que tener un marcador, también llamado "1", en el segundo volumen.

en: Drawing Fiducial Markers
es: Dibujando Marcadores Fiduciales

en: Fiducial markers can be added to any of the data sets in the study in a variety of ways. For the currently active data set, hitting the "Edit-&gt;Add fiducial mark" menu item will drop a fiducial maker at the currently viewed location. Fiducial marks can be added for the active data set directly from the views by pressing ctrl-right mouse button, which will drop a fiducial marker at the point that the mouse is currently at. Finally, fiducial markers can be added to non-active data sets by pressing ctrl-right mouse button while hovering over a data set's name in the study list.
es: Se pueden añadir marcadores fiduciales de varias maneras. Para el volumen activo, seleccionar el item del menu "Edit-&gt;Add fiducial mark" y añadirá una marca fiducial en la vista seleccionada. Las marcas fiduciales se pueden añadir directamente a la vista activa pulsando CTRL+botón 3 del raton, que dispondrá una marca fiducial en el lugar que apunte el ratón. Finalmente, los marcadores fiduciales se pueden añadir a volúmenes inactivos pulsando CTRL+botón 3 del ratón mientras se selecciona el volumen de la lista del estudio.

en: After being created, the fiducial marker can be moved by clicking on the marker point shown in any of the views.
es: Después de crear, el marcador fiducial puede ser movido pulsando el punto de marcaje en cualquiera de las tres vistas.

en: Fiducial Marker Modification Dialog Box
es: Caja de Diálogo de Modificación de Marcadores Fiduciales

en: To modify parameters of a fiducial mark, right click the point in the study list to pop-up the Fiducial Marker Modification Dialog. From this dialog, the name and location of the fiducial marker can be altered.
es: Para modificar los parámetros de una marca fiducial, pulse el botón 3 en la lista del estudio para desplegar la Caja de Diálogo de Modificación de Marcadores Fiduciales. Desde este diálogo, se pueden modificar el nombre y localización del marcador fiducial.

en: Crop Wizard
es: Herramienta de Recorte(Crop Wizard)

en: Coming soon. Note that only what is strictly inside the cursor lines is saved. What's underneath and outside the cursor lines is cropped away.
es: Permite recortar los volúmenes quitando de ellos las partes carentes de interés. Se abrirá un diálogo con el MIP del plano axial, existiendo unos modificadores de dimensión que dibujarán una caja en el MIP, una vez seleccionado pulsar Next y aparecerá el MIP coronal, ajustarlo y pulsar Next de nuevo aparecerá el MIP sagital, recortando así, el volumen desde los 2 planos.

en: Filter Wizard
es: Herramienta de Filtrado

en: Fly Through Wizard
es: Creación de video en una Orientación(Fly Through Wizard)

en: Note, will generally get much better results for fly through if using trilinear interpolation.
es: Nota, los resultados son mejores si se usa interpolación trilineal.

en: ROI Statistics
es: ROI Estadísticas

en: A description of the ROI statistics tool can be found at: <xref linkend="roi_statistics"/>.
es: La descripción de la estadísticas del ROI en: <xref linkend="roi_statistics"/>.

en: Permission is granted to copy, distribute and/or modify this document under the terms of the <citetitle>GNU Free Documentation License</citetitle>, Version 1.1 or any later version published by the Free Software Foundation with no Invariant Sections, no Front-Cover Texts, and no Back-Cover Texts. You may obtain a copy of the <citetitle>GNU Free Documentation License</citetitle> from the Free Software Foundation by visiting <ulink type="http" url="http://www.fsf.org">their Web site</ulink> or by writing to the below address.
es: Se garantiza la copia, distribución y/o modificación de este documento bajo los términos de la Licencia de Documentación GNU, Versión 1.1 o posterior publicado por la Free Software Foundation Puede obtener una copia de GNU Free Documentation License de Free Software Foundation visitando <ulink type="http" url="http://www.fsf.org">su sitio web</ulink> o escribiendo a la dirección abajo indicada.

en: This program is free software; you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your option) any later version.
es: Este programa es software libre; puede distribuirlo y/o modificarlo bajo los términos GNU General Public License publicada por el Free Software Foundation; o version 2 de la Licencia, o (bajo su criterio) cualquier versión posterior.

en: This program is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License for more details.
es: Este programa se distribuye con la esperanza de ser útil, pero SIN NINGUNA GARANTIA, sin incluso ninguna garantía MERCANTIL implícita o sin garantizar la CONVENIENCIA PARA UN PROPÓSITO PARTICULAR. Véase la Licencia Pública General de GNU para más detalles.

en: You should have received a copy of the GNU General Public License along with this program; if not, write to: <address> The Free Software Foundation, Inc., <street>59 Temple Place</street> - Suite 330, <city>Boston</city>, <state>MA</state><postcode>02111-1307</postcode>, <country>USA</country></address>
es: Debería haber recibido una copia de la Licencia Pública General junto con este programa. Si no ha sido así, escriba a la Free Software Foundation, <address> The Free Software Foundation, Inc., <street>59 Temple Place</street> - Suite 330, <city>Boston</city>, <state>MA</state><postcode>02111-1307</postcode>, <country>USA</country></address>

en: For more details see the file COPYING in the source distribution of AMIDE.
es: Para más detalles vea la copia distribuida con uAMIDE
